Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl21Q3U410 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl21Q3U410 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl21Q3U410 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl21Q3U410 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl21Q3U410 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl21Q3U410 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl21Q3U410 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl21Q3U410 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl21Q3U410 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms