Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf149Q3U2C5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms