Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Brms1lQ3U1T3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1lQ3U1T3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms