Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms