Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hace1Q3U0D9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hace1Q3U0D9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hace1Q3U0D9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms