Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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Hbq1bQ3U0A6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hbq1bQ3U0A6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Hbq1bQ3U0A6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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Hbq1bQ3U0A6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Hbq1bQ3U0A6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Hbq1bQ3U0A6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Hbq1bQ3U0A6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hbq1bQ3U0A6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Hbq1bQ3U0A6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Hbq1bQ3U0A6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hbq1bQ3U0A6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Hbq1bQ3U0A6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms