Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmtk2Q3TYD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lmtk2Q3TYD6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lmtk2Q3TYD6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lmtk2Q3TYD6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms