Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
9130409I23RikQ3TS87 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
9130409I23RikQ3TS87 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms