Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TQQ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q3TQQ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TQQ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms