Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XylbQ3TNA1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XylbQ3TNA1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms