Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Echdc2Q3TLP5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Echdc2Q3TLP5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Echdc2Q3TLP5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms