Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrp4cQ3TKR3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms