Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afvQ3THW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H2afvQ3THW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2afvQ3THW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms