Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RubcnlQ3TD16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnlQ3TD16 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnlQ3TD16 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms