Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc69Q3TCJ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms