Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms