Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mfsd2bQ3T9M1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mfsd2bQ3T9M1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd2bQ3T9M1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd2bQ3T9M1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms