Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Prex2Q3LAC4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Prex2Q3LAC4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Prex2Q3LAC4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Prex2Q3LAC4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Prex2Q3LAC4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prex2Q3LAC4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms