Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Rtl9Q32KG4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl9Q32KG4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Rtl9Q32KG4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl9Q32KG4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Rtl9Q32KG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rtl9Q32KG4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rtl9Q32KG4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Rtl9Q32KG4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rtl9Q32KG4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.1 ms