Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M3Q31093 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M3Q31093 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms