Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col24a1Q30D77 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col24a1Q30D77 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms