Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rspo3Q2TJ95 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rspo3Q2TJ95 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rspo3Q2TJ95 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms