Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pi4k2aQ2TBE6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pi4k2aQ2TBE6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pi4k2aQ2TBE6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms