Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Vax1Q2NKI2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms