Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chrna5Q2MKA5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrna5Q2MKA5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrna5Q2MKA5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms