Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp1aQ2LKU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp1aQ2LKU9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms