Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
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Shroom4Q1W617 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
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Shroom4Q1W617 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
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Shroom4Q1W617 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Shroom4Q1W617 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
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Shroom4Q1W617 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
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Shroom4Q1W617 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
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Shroom4Q1W617 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Shroom4Q1W617 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
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Shroom4Q1W617 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
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Shroom4Q1W617 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
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Shroom4Q1W617 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Shroom4Q1W617 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Shroom4Q1W617 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Shroom4Q1W617 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Shroom4Q1W617 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
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Shroom4Q1W617 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
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Shroom4Q1W617 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Shroom4Q1W617 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Shroom4Q1W617 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
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Shroom4Q1W617 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
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Shroom4Q1W617 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Shroom4Q1W617 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Shroom4Q1W617 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Shroom4Q1W617 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms