Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam171bQ14CH0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms