Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Tdrd9Q14BI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tdrd9Q14BI7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd9Q14BI7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Tdrd9Q14BI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd9Q14BI7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd9Q14BI7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd9Q14BI7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd9Q14BI7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tdrd9Q14BI7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tdrd9Q14BI7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms