Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VgfQ0VGU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VgfQ0VGU4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VgfQ0VGU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms