Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hif3aQ0VBL6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hif3aQ0VBL6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms