Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kndc1Q0KK55 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kndc1Q0KK55 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kndc1Q0KK55 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms