Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ttc21bQ0HA38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ttc21bQ0HA38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ttc21bQ0HA38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms