Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc4Q08624 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxc4Q08624 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc4Q08624 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms