Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tff1Q08423 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tff1Q08423 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms