Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb2Q08331 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb2Q08331 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms