Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad51Q08297 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad51Q08297 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms