Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn2Q08093 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnn2Q08093 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn2Q08093 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms