Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F13bQ07968 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F13bQ07968 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
F13bQ07968 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F13bQ07968 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms