Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf3Q07104 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdf3Q07104 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms