Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox4Q06831 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox4Q06831 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox4Q06831 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms