Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrstQ06666 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrstQ06666 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrstQ06666 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms