Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprgQ05909 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprgQ05909 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprgQ05909 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PtprgQ05909 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprgQ05909 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprgQ05909 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms