Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fmn1Q05860 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Fmn1Q05860 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Fmn1Q05860 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms