Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hspg2Q05793 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hspg2Q05793 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hspg2Q05793 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms