Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcn1Q05186 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rcn1Q05186 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rcn1Q05186 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms