Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox10Q04888 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox10Q04888 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms