Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Emx2Q04744 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Emx2Q04744 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms