Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CkbQ04447 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CkbQ04447 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CkbQ04447 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CkbQ04447 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CkbQ04447 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CkbQ04447 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CkbQ04447 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms