Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnd1Q03719 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnd1Q03719 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnd1Q03719 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms